Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms