Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms