Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc84Q4VA36 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms