Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc185Q3V118 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc185Q3V118 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms