Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0F0

Rimbp3, RIMS-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rimbp3Q3V0F0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rimbp3Q3V0F0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rimbp3Q3V0F0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms