Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3V0E1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3V0E1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3V0E1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3V0E1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3V0E1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q3V0E1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3V0E1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3V0E1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3V0E1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3V0E1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms