Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn13Q3UW68 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn13Q3UW68 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn13Q3UW68 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn13Q3UW68 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Capn13Q3UW68 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn13Q3UW68 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn13Q3UW68 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn13Q3UW68 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn13Q3UW68 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn13Q3UW68 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn13Q3UW68 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn13Q3UW68 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn13Q3UW68 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn13Q3UW68 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn13Q3UW68 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn13Q3UW68 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn13Q3UW68 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn13Q3UW68 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn13Q3UW68 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn13Q3UW68 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn13Q3UW68 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Capn13Q3UW68 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Capn13Q3UW68 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms