Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
H2-Eb2Q3UUV9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H2-Eb2Q3UUV9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms