Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Chpf2Q3UU43 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms