Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkain3Q3URJ8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkain3Q3URJ8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms