Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc61Q3UJV1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms