Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf3b2Q3UJB0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf3b2Q3UJB0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms