Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf224Q3UIW8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf224Q3UIW8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms