Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrrc58Q3UGP9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms