Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VwceQ3U515 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VwceQ3U515 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms