Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hectd3Q3U487 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hectd3Q3U487 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms