Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1J4

Ddb1, DNA damage-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb1Q3U1J4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ddb1Q3U1J4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ddb1Q3U1J4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddb1Q3U1J4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddb1Q3U1J4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddb1Q3U1J4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddb1Q3U1J4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddb1Q3U1J4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms