Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc174Q3U155 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc174Q3U155 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc174Q3U155 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc174Q3U155 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc174Q3U155 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms