Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc9Q3U0M1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms