Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hace1Q3U0D9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms