Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc28Q3TX51 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc28Q3TX51 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc28Q3TX51 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc28Q3TX51 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc28Q3TX51 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc28Q3TX51 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc28Q3TX51 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc28Q3TX51 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc28Q3TX51 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc28Q3TX51 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc28Q3TX51 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc28Q3TX51 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms