Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf6Q3TWW8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srsf6Q3TWW8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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