Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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