Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CiartQ3TQ03 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CiartQ3TQ03 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms