Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLH4

Prrc2c, Protein PRRC2C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2cQ3TLH4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prrc2cQ3TLH4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrc2cQ3TLH4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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