Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Smarca4Q3TKT4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Smarca4Q3TKT4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms