Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp39Q3TIX9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms