Protein–RNA interactions for Protein: Q3LAC4

Prex2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex2Q3LAC4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prex2Q3LAC4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prex2Q3LAC4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prex2Q3LAC4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prex2Q3LAC4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prex2Q3LAC4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prex2Q3LAC4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prex2Q3LAC4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prex2Q3LAC4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prex2Q3LAC4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prex2Q3LAC4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms