Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
H2-M3Q31093 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M3Q31093 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms