Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vax1Q2NKI2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vax1Q2NKI2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms