Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp1aQ2LKU9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms