Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Shroom4Q1W617 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Shroom4Q1W617 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Shroom4Q1W617 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Shroom4Q1W617 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Shroom4Q1W617 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Shroom4Q1W617 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Shroom4Q1W617 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Shroom4Q1W617 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Shroom4Q1W617 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Shroom4Q1W617 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Shroom4Q1W617 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Shroom4Q1W617 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Shroom4Q1W617 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Shroom4Q1W617 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Shroom4Q1W617 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Shroom4Q1W617 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Shroom4Q1W617 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Shroom4Q1W617 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Shroom4Q1W617 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Shroom4Q1W617 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Shroom4Q1W617 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Shroom4Q1W617 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Shroom4Q1W617 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Shroom4Q1W617 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms