Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp2b3Q0VF55 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms