Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Itgb8Q0VBD0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itgb8Q0VBD0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms