Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc45a4Q0P5V9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc45a4Q0P5V9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc45a4Q0P5V9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc45a4Q0P5V9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc45a4Q0P5V9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc45a4Q0P5V9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc45a4Q0P5V9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc45a4Q0P5V9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc45a4Q0P5V9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc45a4Q0P5V9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc45a4Q0P5V9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc45a4Q0P5V9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc45a4Q0P5V9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc45a4Q0P5V9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc45a4Q0P5V9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc45a4Q0P5V9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms