Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf541Q0GGX2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf541Q0GGX2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms