Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc4Q08624 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc4Q08624 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms