Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tff1Q08423 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tff1Q08423 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tff1Q08423 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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