Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Col9a2Q07643 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Col9a2Q07643 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms