Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gdf9Q07105 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gdf9Q07105 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms