Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Siah1bQ06985 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Siah1bQ06985 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms