Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrstQ06666 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrstQ06666 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrstQ06666 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrstQ06666 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrstQ06666 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SrstQ06666 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms