Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp2Q06649 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp2Q06649 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms