Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPINDOCQ05AH6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPINDOCQ05AH6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms