Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Caprin2Q05A80 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms