Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmp11Q02853 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms