Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nucb1Q02819 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nucb1Q02819 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms