Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Htr1fQ02284 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htr1fQ02284 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htr1fQ02284 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htr1fQ02284 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htr1fQ02284 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htr1fQ02284 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htr1fQ02284 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htr1fQ02284 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Htr1fQ02284 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htr1fQ02284 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htr1fQ02284 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htr1fQ02284 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htr1fQ02284 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htr1fQ02284 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms