Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd1Q01822 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxd1Q01822 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms