Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mc1rQ01727 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mc1rQ01727 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms